Một loài động vật mà giới cái là XX, giới đực là XY, alen A quy...

Xét riêng tỉ lệ F1​:
- Mỗi giới đều có 3 mắt đỏ: 1 mắt trắng A, a thuộc NST thường và P xảy ra phép lai Aa x Aa.
- Tính trạng màu sắc thân phân bố không đều ở 2 giới, chứng tỏ có 1 trong 2 gen liên kết vùng không tương đồng của NST X, giả sử B liên kết X.
Khi xét chung tỉ lệ, có 9 xám: 7 đen P có phép lai BbXD​Xd​ x BbXD​Y.
Gom chung cả 2 loại tính trạng, F1​ có tỉ lệ mắt đỏ, thân xám chiếm 49,5%; tỉ lệ này khác phân ly độc lập Có liên kết gen .
Thấy rằng, A thuộc NST thường phân ly độc lập với D thuộc X, B thuộc NST thường phân ly độc lập với D thuộc X. A liên kếtB
Do vậy: A-B-D- = 0,495 = A-B- x 0,75D- A-B- = 0,66 nên aabb = 0,66 – 0,5 = 0,16 = 0,4ab x 0,4ab.
Cho nên, hoán vị gen đã xảy ra với tần số f = 1 – 2 x 0,4 = 0,2 = 20%.
P có phép lai ♀ x ♂ .
Đực mắt đỏ, thân xám có 3 alen trội